Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc3A6H6S0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Herc3A6H6S0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Herc3A6H6S0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms