Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl41A2AUC9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl41A2AUC9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms