Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pramef17A2ASJ1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pramef17A2ASJ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pramef17A2ASJ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms