Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdr2lA2A6T1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdr2lA2A6T1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms