Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Fam71e1A1L3C1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Fam71e1A1L3C1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Fam71e1A1L3C1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms