Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trbv23A0A0A6YWQ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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