Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Trim43b-201ENSMUST00000167113 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC164437.1-201ENSMUST00000227321 2308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm14663-201ENSMUST00000118474 1153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rgs5-202ENSMUST00000152809 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm20463-201ENSMUST00000174756 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ciao1-205ENSMUST00000174863 531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm44166-201ENSMUST00000204070 515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC115891.2-201ENSMUST00000218448 1341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rita1-202ENSMUST00000111884 733 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm3244-201ENSMUST00000120938 390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm3383-203ENSMUST00000178414 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm3194-201ENSMUST00000180143 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm43246-201ENSMUST00000197597 564 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Zfand1-201ENSMUST00000037839 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grin2bQ01097 Gm24432-201ENSMUST00000104075 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mup9-201ENSMUST00000107506 721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm12192-201ENSMUST00000120146 487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mup9-207ENSMUST00000132829 598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm24912-201ENSMUST00000157291 117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm9662-201ENSMUST00000216748 1206 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Pqbp1-201ENSMUST00000033497 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mup11-201ENSMUST00000084544 601 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Olfr132-201ENSMUST00000087128 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mup16-201ENSMUST00000095051 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Nps-201ENSMUST00000097983 840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm10741-201ENSMUST00000218151 1748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Bnip3-201ENSMUST00000106112 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Gm34821-202ENSMUST00000209114 1949 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Grin2bQ01097 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms