Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sema6a-203ENSMUST00000115449 6815 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Tomm40l-201ENSMUST00000005817 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SbdsP70122 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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