Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pde2a-212ENSMUST00000211368 3885 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm17090-201ENSMUST00000171768 490 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Mir8113-201ENSMUST00000184956 129 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm16299-201ENSMUST00000162724 2766 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Arhgap28-203ENSMUST00000164647 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Bhlhe40-201ENSMUST00000032194 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cd28P31041 Pcx-202ENSMUST00000113825 4044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm5114-201ENSMUST00000108017 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ccdc136-209ENSMUST00000181464 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Rexo5-202ENSMUST00000084644 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Lonp2-203ENSMUST00000122188 2372 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gimap8-203ENSMUST00000203509 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Col6a1-201ENSMUST00000001147 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 AC102847.1-201ENSMUST00000228390 2498 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Nbr1-201ENSMUST00000071537 3239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cel-201ENSMUST00000028161 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm43795-201ENSMUST00000202051 2366 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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Cd28P31041 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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Cd28P31041 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cd28P31041 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms