Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Akap2-204ENSMUST00000102902 6993 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Amph-204ENSMUST00000200466 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Wee2-201ENSMUST00000038907 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Dcdc2a-202ENSMUST00000069614 6634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Ablim1-206ENSMUST00000111528 2481 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cmah-201ENSMUST00000050859 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Vpreb1P13372 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms