Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm10390-201ENSMUST00000180812 3975 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PolP10400 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PolP10400 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Rhbdd1-201ENSMUST00000027322 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Zfp936-203ENSMUST00000202535 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PolP10400 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms