Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp12Q9D9M2 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms