Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 CT009713.3-201ENSMUST00000224987 1565 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
NapbP28663 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
NapbP28663 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
NapbP28663 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm42714-201ENSMUST00000202063 1364 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 CT025689.5-201ENSMUST00000224316 986 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm4883-201ENSMUST00000085702 528 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
NapbP28663 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm17120-201ENSMUST00000164734 743 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NapbP28663 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms