Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 C8b-202ENSMUST00000065072 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Blnk-202ENSMUST00000117695 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc21aQ8C0S4 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms