Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Nek5-201ENSMUST00000169834 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Dpysl2-201ENSMUST00000022629 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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