Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sh2d6-201ENSMUST00000089687 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Smim7-203ENSMUST00000167290 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm45193-201ENSMUST00000204686 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tbx22-202ENSMUST00000118986 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Fes-208ENSMUST00000206728 2707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Snx6-204ENSMUST00000218934 1441 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms