Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms