Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ctns-201ENSMUST00000006103 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Skap2Q3UND0 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms