Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slco4c1-201ENSMUST00000071985 4908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pex5-203ENSMUST00000112530 3051 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SbdsP70122 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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