Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Slc5a1-201ENSMUST00000011178 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Prmt7-201ENSMUST00000071592 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sidt2-202ENSMUST00000114573 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Homer1-204ENSMUST00000102752 5713 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms