Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm28988-201ENSMUST00000191363 1897 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ddhd2-201ENSMUST00000033975 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm19656-201ENSMUST00000208543 4610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Lsm6-204ENSMUST00000146824 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm45349-201ENSMUST00000210285 1074 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 4930533K18Rik-201ENSMUST00000058942 1259 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm3411-201ENSMUST00000170104 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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H2-Eb1P04230 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 CT009757.1-201ENSMUST00000222801 738 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-Eb1P04230 Clasp2-203ENSMUST00000166734 4108 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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