Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ncmap-203ENSMUST00000105858 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccdc97Q9DBT3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms