Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Trpc5-201ENSMUST00000040184 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ttll7-203ENSMUST00000106134 2664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trub1Q8C0D0 Ribc1-201ENSMUST00000026288 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trub1Q8C0D0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms