Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Arhgap26-216ENSMUST00000155576 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm26911-201ENSMUST00000181770 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ano4-204ENSMUST00000182341 3959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm2071-201ENSMUST00000193335 774 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Klk1b4-201ENSMUST00000077354 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nos2-203ENSMUST00000214397 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm31763-202ENSMUST00000218205 1724 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8BGC1 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm43480-201ENSMUST00000201201 416 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm15663-201ENSMUST00000145794 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms