Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Defa-rs1P17533 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms