Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sytl4-202ENSMUST00000113294 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nctc1-202ENSMUST00000132167 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-Eb1P04230 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-Eb1P04230 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-Eb1P04230 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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H2-Eb1P04230 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cdh8-205ENSMUST00000142475 3216 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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