Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Grxcr2-201ENSMUST00000097591 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm10857-201ENSMUST00000195343 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm14654-201ENSMUST00000118620 447 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Tbce-201ENSMUST00000039894 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Mapk1ip1-202ENSMUST00000118810 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp19Q3UJD6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms