Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Wdr77-201ENSMUST00000010278 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rnf13-201ENSMUST00000041826 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rtp1-201ENSMUST00000038730 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Spdye4b-201ENSMUST00000031574 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Stambp-201ENSMUST00000068054 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nlrc5-204ENSMUST00000182409 4552 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sdr42e1-202ENSMUST00000173522 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zfp820-201ENSMUST00000084141 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Disp2-203ENSMUST00000110843 2949 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slc12a4-202ENSMUST00000116429 3755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms