Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Klf17-201ENSMUST00000062747 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mgat4a-202ENSMUST00000143636 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm7356-201ENSMUST00000186636 1527 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm7358-201ENSMUST00000189454 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms