Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm18745-201ENSMUST00000216018 548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Defa22-201ENSMUST00000098897 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm43290-201ENSMUST00000200359 1557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mir6378-201ENSMUST00000183357 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm45126-201ENSMUST00000206702 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ilf3-203ENSMUST00000213518 3513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm8606-201ENSMUST00000121482 888 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm5776-201ENSMUST00000122119 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 4930519F09Rik-201ENSMUST00000159347 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Olfr1415-201ENSMUST00000071521 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gngt2-206ENSMUST00000107712 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Sertad4-201ENSMUST00000016406 3090 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mir378b-201ENSMUST00000175244 92 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm18513-201ENSMUST00000177313 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm3466-201ENSMUST00000181797 1192 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm27483-201ENSMUST00000184983 71 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Shisa5-204ENSMUST00000196954 843 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tcl1b4-201ENSMUST00000000718 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ap3m1-201ENSMUST00000022371 1770 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Pfn4-201ENSMUST00000020967 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm14735-201ENSMUST00000121772 3088 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms