Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 2610042L04Rik-202ENSMUST00000165466 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cep63-211ENSMUST00000216281 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Clnk-201ENSMUST00000169819 1700 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Clnk-202ENSMUST00000171633 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 2010009K17Rik-201ENSMUST00000186977 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Oaz3-206ENSMUST00000204548 787 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Lyzl1-202ENSMUST00000120837 652 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm5409-201ENSMUST00000160346 698 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Igkv4-62-201ENSMUST00000177795 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Cx3cl1-206ENSMUST00000211956 470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Olfr550-201ENSMUST00000098225 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Chd1P40201 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm5394-201ENSMUST00000121935 975 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tpsab1-202ENSMUST00000153118 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 AC154589.1-201ENSMUST00000228694 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm9999-201ENSMUST00000070660 486 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm12966-201ENSMUST00000118024 810 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms