Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Galnt1-201ENSMUST00000000430 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Bub1b-201ENSMUST00000038341 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cdc6-201ENSMUST00000092706 4614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Tulp2-209ENSMUST00000210813 2153 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Polr1e-204ENSMUST00000133157 2986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 AC122197.1-201ENSMUST00000220281 2142 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Sptan1-208ENSMUST00000129241 7585 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Rbm19-201ENSMUST00000031590 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Itgbl1-201ENSMUST00000049681 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Vpreb1P13372 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms