Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms