Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Osbpl5-201ENSMUST00000020411 3994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mis18bp1-201ENSMUST00000052201 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Uqcc1-204ENSMUST00000109636 2633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nrep-201ENSMUST00000051087 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rab11fip3-201ENSMUST00000118828 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Irf9-203ENSMUST00000134863 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Glb1l2-202ENSMUST00000066560 3688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ctage5-220ENSMUST00000177225 2872 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Skap2Q3UND0 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms