Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gpx5-201ENSMUST00000110491 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms