Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
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