Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Epb42P49222 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms