Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ccna1-201ENSMUST00000029368 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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