Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm15550-201ENSMUST00000120824 1748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm20642-201ENSMUST00000177185 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm43499-201ENSMUST00000202091 2107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ccl19-201ENSMUST00000102957 745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm27395-201ENSMUST00000183938 460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 4930448C13Rik-205ENSMUST00000221781 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC118704.1-201ENSMUST00000225022 695 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm44744-201ENSMUST00000208234 852 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Calcoco2-201ENSMUST00000068686 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 9530056K15Rik-201ENSMUST00000061947 2315 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm6351-203ENSMUST00000139828 1542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rassf9-201ENSMUST00000055355 1526 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm11668-201ENSMUST00000119655 701 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm28167-201ENSMUST00000187644 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
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