Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hnrnpc-202ENSMUST00000164655 2843 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gpn1-201ENSMUST00000076949 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfp672-202ENSMUST00000064786 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cdc25b-202ENSMUST00000079857 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms