Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmg20bQ9Z104 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmg20bQ9Z104 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmg20bQ9Z104 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmg20bQ9Z104 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms