Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NgfrQ9Z0W1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NgfrQ9Z0W1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NgfrQ9Z0W1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms