Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms