Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ArcQ9WV31 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ArcQ9WV31 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ArcQ9WV31 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms