Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnip1Q9WUU8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnip1Q9WUU8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnip1Q9WUU8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms