Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl5Q9WUP7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl5Q9WUP7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms