Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mixl1Q9WUI0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mixl1Q9WUI0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mixl1Q9WUI0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.2 ms