Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd6ipQ9WU78 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd6ipQ9WU78 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd6ipQ9WU78 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd6ipQ9WU78 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdcd6ipQ9WU78 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pdcd6ipQ9WU78 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd6ipQ9WU78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms