Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim3Q9R1R2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim3Q9R1R2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms