Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Htra1Q9R118 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Htra1Q9R118 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms