Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chrna6Q9R0W9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chrna6Q9R0W9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Chrna6Q9R0W9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms